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TogoTV international

TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2012-03-13

_ [presentation][JST][BIRD] 【ゲノムリテラシー講座】分子系統解析(講義3)

【ゲノムリテラシー講座】分子系統解析(講義3)
本日の統合TVは、JSTバイオインフォマティクス推進センター(BIRD) ゲノムリテラシー講座において2009年9月26日に開催された、バイオインフォマティクスの基礎:分子生物学データベース から、村上 勝彦 (社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム)による「分子系統解析(講義3)」をお送りします。約51分です。 YouTube版はこちらです。
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Keywords: DBCLS,NBDC,BIRD,JST
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原著作者はバイオサイエンスデータベースセンターですCopyright holder is National Bioscience Database Center, JST. Creative Commons License

スライドをクリックすると、その場面から動画が再生されます。When a slide is clicked, video is played from the scene.

title 分子系統解析 分子系統解析と系統樹 系統樹は節(node)と枝(branch、edge)からなるグラフ(graph) 有根系統樹と無根系統樹 無根系統樹に根をつける方法 Newick format 同じ系統樹を表すNewick formatは複数 進化距離 主な分子系統樹推定法 系統樹作成の前に、マルチプルアライメントを作成する UPGMA法 UPGMA法(概要) 近隣結合法 枝の長さLiの計算 最大節約法 最尤法(Maximum likelihood method、ML法) 系統樹推定プログラム 同義置換と非同義置換(1) 同義置換と非同義置換(2) 相同性と類似性 オーソログとパラログ 実習マルチプル・アライメントの作成法CLUSTALWを例に マルチプルアライメントの例 ペアワイズ・アライメントとマルチプルアライメントの違い CLUSTALWの基本アルゴリズム DDBJにおけるCLUSTALW データ入力画面 結果表示画面 TreeViewを用いた分子系統樹表示

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