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TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2011-07-21

_ [NGS][presentation][ゲノム][遺伝子][発現情報] HeliScope CAGE法について

HeliScope CAGE法について

本日の統合TVは、2011年7月15日に開催された、統合データベース講演会: AJACS本郷9から、理化学研究所 オミックス基盤研究領域(OSC) 伊藤 昌可 先生による「HeliScope CAGE法について」をお送りします。約33分です。

YouTube版はこちらです。

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Keywords: CAGE,Helicos,NGS,HeliScope,Cap Analysis of Gene Expression
References: 21596820

スライドをクリックすると、その場面から講演をご覧いただけます。

タイトル Contents 次世代シーケンサーによる様々な解析法 定性シーケンスと定量シーケンス 定量シーケンス 定量シーケンス2 定量シーケンス3 定量シーケンス4 HeliScope HeliScope Sequencing HeliScopeの特徴 CAGE キャップ・トラップ技術 制限酵素を利用したタグ化 制限酵素を利用したタグ化2 タグ化CAGEシーケンシング 非常に長い工程 旧タグ化CAGEの問題点 CAGEとHeliScopeの組み合わせに期待される相乗効果 HeliScope CAGE タグ化CAGE調整工程 まだ工程が複雑で長い 排除 SPRI核酸精製 HeliScope CAGE2 HeliScope CAGE3 HeliScope CAGE4 HeliScope CAGE5 HeliScope CAGE Reproducibility HeliScope CAGE Reproducibility2 Comparison between previos 454 CAGE and HeliScope CAGE Comparison2 Differential analysis between different starting source amount Shape analysis of TSS signal Artifactual antisence and exon painting HeliScope CAGEデータに関する注意点 HeliScope CAGE cDNA調製 ハイスループット化コンセプト HeliScope CAGE cDNA調製2 まとめ Acknowledgement ご静聴ありがとうございました


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