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TogoTV international

TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2011-07-20

_ [presentation][化合物] 創薬インフォマティクスを用いた医薬品探索II

創薬インフォマティクスを用いた医薬品探索II

本日の統合TVは、2011年度夏学期(4〜7月)に開講された、東京大学グローバルCOEプログラム「ゲノム情報ビッグバンから読み解く生命圏新領域創成科学特別講義IIから、産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター 創薬分子設計チーム 広川貴次 先生による「創薬インフォマティクスを用いた医薬品探索II」をお送りします。

YouTube版はこちらです。

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Keywords: Ligand Based Drug Design,Fragment Based Drug Design,in silico screening

スライドをクリックすると、その場面から講義をご覧になれます。

バーチャルスクリーニング法の分類 LBDDの目的と方法 Finger Printによる分子表現:MACCS key 類似性基準(定性的特性から) LBDDの目的と方法 ファルマコフォア:イントロダクション ファルマコフォア例(1) ファルマコフォア検索結果例 Pharmacophore Fingerprint FeatureTrees: Reduced graph method LBDDの目的と方法 化合物記述子:イントロダクション 分子表記の次元による記述子分類 簡易記述子(0、1D) Wiener指標(構造記述子) κ形状指標 Polar Surface Area (PSA) TPSA (Ertl et al., J Med Chem, 2000) 物理化学的記述子 距離情報に基づく記述子 オクタノール/水分配係数(logP)の予測 部分構造に基づくlogP計算 logP計算例(Fragment method) logP計算例(Atom contribution method) 記述子による解析:Rule of Five 記述子を用いた解析(2) 化合物分類に重要な化合物物性 記述子を用いた解析:DACCS: Distance function LBDDの目的と方法 ROCS: Gaussian shape modelによる検索 ROCS:重ね合わせとアラインメント方法 講義内容 研究事例紹介:コレステロール代謝経路とCETP阻害(1/6) 医薬品の持つ副作用(2/6) UCSDグループの戦略(3/6) リガンド結合部位の表現(4/6) リガンド結合部位検索およびドッキング結果(5/6) 核内ホルモン受容体が関わるパスウェイ(6/6) 講義内容 これからの医薬品(低分子)探索研究 Fragment-based drug design インシリコによるFBDDの課題 タンパク質間相互作用を標的とした次世代分子標的創薬 IL-2/IL-2Ra 結合部位の特性について 結合部位の特性について


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