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統合TVの論文が Briefings in Bioinformatics に掲載されました!(2011/7/29)

TogoTV international

TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2011-07-05

_ [塩基配列][配列解析] MEGAを使って配列アラインメントおよび系統解析をする

MEGAを使って配列アラインメントおよび系統解析をする

MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis)は、DNA、タンパク質配列データの分子進化・系統学的解析を行うためのフリーのソフトウェアで、Tamura K らによって作成されています。MEGAの特徴は、シークエンサーのファイル(ab1, abi, scfなど)を直接読み込めるため、波形データと配列データを一緒に解析できることです。また、Windows、Mac OS、Linuxとマルチプラットフォームで動作します。

今回は、いくつかの遺伝子(PPARやTP53など)を例として、多重アラインメントの実行と系統樹を作成する方法を説明します。

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【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. インストール(19秒)
  2. 2. アラインメント(1分25秒)
  3. 3. 系統樹解析(6分50秒)

YouTube版はこちらです。


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