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2011-02-24

_ [ゲノム][遺伝子] BioMart を用いて Affymetrix と Agilent のマイクロアレイのプローブ ID 対応表を作成する 2011

BioMart を用いて Affymetrix と Agilent のマイクロアレイのプローブ ID 対応表を作成する 2011

Biomartは、the Ontario Institute forCancer Research (OiCR) とthe European Bioinformatics Institute (EBI) が共同で開発しているクエリ指向型データ管理システムです。

今回は、この BioMart を用いてAffymetrix と Agilent のプローブ ID 対応表を作成し、タブ区切りファイル(TSV)として保存する方法を紹介します。

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. BioMart Central Portal の基本的な説明(58秒)
  2. 2. Filters での、データ抽出フィルターの設定(1分39秒)
  3. 3. Attributes での、表示する属性の選択(2分36秒)
  4. 4. 結果の表示(3分3秒)
  5. 5. 結果をファイルに保存する(4分25秒)
  6. 6. 保存したファイルをテキストエディタや表計算ソフトで開く(5分8秒)

Youtube 版はこちらです。

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