RefSeqとは、Reference Sequenceの略で、NCBIが提供する配列解析に使うための、文字通り"reference"（リファレンス）となるべき配列データベースのことです。

今回の番組では、RefSeqデータベースから自分の興味ある遺伝子のRefSeq IDを調べ、そのmRNA配列とアミノ酸配列を取得する方法について説明します。

「entrez」を検索します。

「Entrez cross-database search」を選択します。

Entrezで調べたい遺伝子の名称を検索します。

ここでは866件のヒットがある、「Nucleotide」を選択します。

検索結果の一覧には、ヒト、マウス、ラットなどに関するデータが混在します。

特定の生物に関するデータを見る方法について、マウスを例にとって説明します。

Igf2(Mus musculus)をクリックします。

ここでは遺伝子の領域が表示されます。

同じ名称の遺伝子でも、転写やスプライシングの仕方が複数ある場合はそれぞれのisoformに別のIDが与えられています。

Got to [reference sequence details]をクリックします。

「NM_〜」がmRNAの配列に割り当てられているRefSeq IDです。

「NP_〜」がアミノ酸の配列に割り当てられているRefSeq IDです。

次に、mRNAの配列を実際に見てみましょう。

「NM_~」をクリックします。

「Go to」「Sequence」をクリックします。

mRNAの配列が表示されます。

ここでは、配列を見やすくするための数字が表示されています。

次に、アミノ酸配列について、このような数字が振られていない表示の仕方を説明します。

アミノ酸の配列を見るには、「NP_~」をクリックします。

「Display Settings」、「FASTA」、次に「Apply」をクリックします。

このように、FASTA形式で配列が表示されます。

FASTA形式とは「>」で始まる1行のタイトル行と、2行目以降の実際の配列で構成される形式です。

最後に、配列情報をファイルに保存する方法を説明します。

「Send to」「File」をクリックします。

FormatがFASTAになっていることを確認し、「Create File」をクリックします。

テキストエディタ（「メモ帳」など）でファイルを開くために、ファイル名の最後に「.txt」を追加します。

この様に作成したファイルを開くことが出来ます。