統合TV 統合TVは、ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)が発信する生命科学分野の有用なデータベース(DB)やウェブツールの活用法を動画で紹介するウェブサイトです。くわしくは はじめての方へ をご覧ください。ご質問、ご要望は、お問い合わせ もしくは ライフサイエンスQA からお願いします。TogoTV beta ('togo' means 'integration' in Japanese) is an archive of tutorial videos expounding how to use biological databases and tools. Although most of contents are currently depicted in Japanese, you can find English contents in TogoTV international. Please post any comments, suggestions, and requests at each content page, e-mail to the address described at the bottom of each page or contact form. This site is provided by Database Center for Life Science (DBCLS) and funded by MEXT Integrated Database Project in Japan.

新しい統合TVはこちらから!→ 統合TV

TogoTV international

TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

番組カテゴリ:BIRD | DBCLS | EMBOSS | English | Firefox | IE6 | IE7 | IE8 | JST | NGS | PC環境設定 | commons | macosx | presentaiton | presentation | safari | winxp | アミノ酸 | ゲノム | ソフトウェア | タンパク質 | パスウェイ解析 | ポータル | 二次構造 | 化合物 | 可視化 | 塩基配列 | 多型情報 | 家系図 | 文献検索 | 構造解析 | 疾患情報 | 発現情報 | 設計ツール | 辞書 | 遺伝子 | 配列解析 Search categories: DBCLS | EMBOSS | English | Firefox | IE6 | IE7 | IE8 | commons | macosx | presentation | safari | winxp | amino acid | genome | protein | pathway analysis | portal | gene | nucleotide sequence | chemical compound | visualization | dictionary | disease information | design tool | polymorphism information | secondary structure | sequence analysis | expression profile | literature search


2011-01-24

_ [presentation][NGS] 新型シーケンサーによる細菌ゲノムの比較解析

新型シーケンサーによる細菌ゲノムの比較解析

本日の統合TVは、2010年度夏学期(5~7月)に開講された、東京大学グローバルCOEプログラム「ゲノム情報ビッグバンから読み解く生命圏新領域創成科学特別講義Iから、国立感染症研究所 病原体ゲノム解析研究センター 黒田誠 先生による「新型シーケンサーによる細菌ゲノムの比較解析」をお送りします。

Get the Flash Player to see this movie.この動画を再生するにはAdobe Flash Player (無料)が必要です

また、JavaScriptをOnにする必要があります。
Keywords: GCOE,Genome Bigbang

YouTube版はこちらです。

スライドをクリックすると、その場面から講義をご覧になれます。

新型シーケンサーによる病原体の網羅解析 次世代(第2世代)シークエンサーでなにしようかな? 次世代シークエンサーによる網羅配列解読 パンデミック・インフルエンザウイルス A/H1N1/2009 の多種性 Influenza virus A/Nagano/RC1-L/H1N1/2009 Euler-SR による de novo assembly Segment ごとのマッピング成績と de novo assembly コンティグ 1 Segment ごとのマッピング成績と de novo assembly コンティグ 2 リファレンス配列との比較 Segment 4 の HA の塩基置換 HA のアミノ酸置換 RT-PCRで確認 HA のアミノ酸置換 1 G172E (antigenic site Sa) タンパク質の立体構造 HA-minor (G172E) の blast 解析 SWISS-MODELによるホモロジーモデリング(HA172) HA のアミノ酸置換 2 G239, N239 (antigenic site Ca2) タンパク質の立体構造 HA-minor (G239N) の blast 解析 検出された細菌種 まとめ


トップ «前の日記(2011-01-23) 最新 次の日記(2011-01-25)» 編集
Creative Commons License「統合TV」は、クリエイティブコモンズ・ライセンス(CC)表示 2.1 日本 のもとでライセンスされています。Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 2.1 Japan License
統合TVのQRコード
文部科学省委託研究開発事業「統合データベースプロジェクト」MEXT Integrated Database Project
大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター 統合TVチームDatabase Center for Life Science (DBCLS), Research Organization of Information and Systems (ROIS)
サイトポリシーSite Policies