_ [presentation][ゲノム][NGS] 次世代シーケンサ配列の登録・データ解析〜クラウド型解析パイプライン・実習assembly/mapping〜

本日の統合TVは、2010年6月23, 24日にライフサイエンス統合データベースセンター（DBCLS）にて開催されたAJACS & 第22回DDBJing 講習会 in 東京より、国立遺伝学研究所 CIB・DDBJ研究センター エンジニア 望月 孝子 氏による「次世代シーケンサ配列の登録・データ解析〜クラウド型解析パイプライン・実習assembly/mapping〜」をお送りします。

次世代シーケンサで読んだ枯草菌のリシーケンスデータを DDBJ Read Annotation Pipeline を使って解析する方法について解説していただきました。具体的には、Illuminaでpaired-endで読んだ配列を Velvet を使ってアセンブリし、BLATで公表済みのゲノムにマッピングする、という一連の操作について紹介しています。

当日の資料（PDF）はコチラ。約25分です。

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Keywords: DDBJ Read Annotation Pipeline,DRA,velvet,BLAT

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原著作者はライフサイエンス統合データベースセンターですCopyright holder is Database Center for Life Science.　

スライドをクリックすると、その場面から講習をご覧になれます。

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