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TogoTV international

TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2010-08-11

_ [presentation][NGS][ゲノム] 次世代シーケンサ配列の登録・データ解析〜次世代シーケンサのクラウド型解析パイプライン〜

次世代シーケンサ配列の登録・データ解析〜次世代シーケンサのクラウド型解析パイプライン〜

本日の統合TVは、2010年6月23, 24日にライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)にて開催されたAJACS & 第22回DDBJing 講習会 in 東京より、国立遺伝学研究所 CIB・DDBJ研究センター 神沼 英里 助教による「次世代シーケンサ配列の登録・データ解析〜次世代シーケンサのクラウド型解析パイプライン〜」をお送りします。

次世代/新型シーケンサの歴史や各機器の特徴などの紹介の後、DDBJで提供しているデータを解析するためのパイプライン DDBJ Read Annotation Pipeline について紹介していただきました。

当日の資料(PDF)はコチラ。約25分です。

YouTube版はこちらです。

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また、JavaScriptをOnにする必要があります。
Keywords: 次世代シーケンサ,454,Illumina,Splexa,Solid,DRA,DDBJ Sequence Read Archive
References: 19850725

スライドをクリックすると、その場面から講習をご覧になれます。

次世代シーケンサ配列の登録・データ解析 次世代シーケンサの歴史 「ゲノム解析で10億円賞金」コンテスト 新旧シーケンサ技術の比較 新型シーケンサの種類 新型シーケンサの技術開発は発展途上 新型シーケンサ大量配列の保存・解析の問題(→クラウド型解析) DDBJ Read Annotation Pipeline パイプラインの特徴1 実験研究者が自己主導で解析可能 パイプラインの特徴2 基本統計量(Quality Score/Coverage等)を自動計算 パイプラインの特徴3 <配列登録支援>DDBJ登録ファイル自動生成 DDBJ Pipelineで何ができるか1 SNP/Structural Variation解析 DDBJ Pipelineで何ができるか2 de novo assembly解析 解析パイプラインの利用にはまずご連絡ください


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