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TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2010-08-02

_ [IE8][タンパク質][可視化][二次構造][構造解析] 万見(Yorodumi)の使い方〜基本と連携〜

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万見(よろずみと読みます)は日本蛋白質データバンク(PDBj)が提供するタンパク質構造解析サービスです。万見は立体構造を見て楽しむことをコンセプトとしています。また、Uniprotとの連携により、詳細なデータを得ることも出来ます。

今回は万見によるシアノバクテリアSynechocystis sp. PCC 6803由来Heme oxygenase-1(ヘム分解を行う酵素)の立体構造データをサンプルとしています。

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【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. PDB IDが分からない場合のランダム検索。(26秒)
  2. 2. PDB IDを用いた検索。(1分3秒)
  3. 3. Heme oxygenase-1の構成要素確認。(2分13秒)
  4. 4. Uniprotとの連携(アノテーション情報の確認)。(3分29秒)
  5. 5. Sequence Viewerとの連携(二次構造情報の確認)。(4分5秒)

YouTube版はこちらです。


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