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TogoTV international

TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2010-07-06

_ [IE8][タンパク質][可視化][DBCLS] TogoProtの使い方〜検索と連携〜

TogoProtの使い方〜検索と連携〜

TogoProtライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)が提供するタンパク質横断検索サービスです。TogoProtの特徴は複数のデータベースを横断して検索を行うことにより、各データベース間の結果を比較し、またタンパク質の立体構造やタンパク間相互作用などタンパク質の構造と機能をまとめて検索できるという利点も存在します。また、Jabionとも連携しています。

今回は自然免疫に関与するタンパク質TLR(Toll-like receptor)のうち、ヒトTLR10を例として用いています。動画内で紹介されている遺伝子百科の使い方は日本語バイオポータルサイトJabionを使い倒す 〜遺伝子百科編〜を、PyMOLの使い方はPyMOLを使い倒すをそれぞれ参照願います。

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【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. TogoProtを用いた検索。(37秒)
  2. 2. Jabionとの連携(遺伝子)。(2分0秒)
  3. 3. HINTdbとの連携(タンパク質相互作用解析)。(3分2秒)
  4. 4. PDBjとの連携(タンパク質立体構造解析)。(3分31秒)

YouTube版はこちらです。


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