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TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2010-04-20

_ [winxp][Firefox][ゲノム][遺伝子][発現情報] Ensembl tips 〜DBCLSで提供しているゲノムアノテーションを表示する〜 2010

Ensembl tips 〜DBCLSで提供しているゲノムアノテーションを表示する〜 2010

Ensemblは、 The Wellcome Trust Sanger InstituteEBI(European Bioinformatics Institute) の共同で開発、維持されているゲノムブラウザ、ゲノムアノテーション閲覧システムのことです。

第四弾の今回は、DBCLSで提供しているゲノムアノテーションをDAS(Distributed Annotation System)を用いてEnsemblに追加して表示する方法について紹介しています。今回はヒトのcDNA配列アノテーション(H-Inv DB)と、ヒトのbodymap EST、マウスのRepresentative Transcript set(FANTOM3)を表示します。

画像をクリックすると動画が再生されます。

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. DASの設定(0分40秒)
  2. 2. H-Invのアノテーションを閲覧する(2分18秒)
  3. 3. FANTOM3のアノテーションを閲覧する(4分18秒)

YouTube版はこちらです。

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また、JavaScriptをOnにする必要があります。
Keywords: ゲノム,ブラウザ,Ensembl,DAS,EST,HInv,アノテーション


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