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TogoTV international

TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2009-12-21

_ [presentation][DBCLS][ポータル][発現情報] 分子生物学会ワークショップ〜統合データベースプロジェクト:オープンで知のめぐりの良い分子生物学を目指して〜

統合データベースプロジェクト:オープンで知のめぐりの良い分子生物学を目指して

本日の統合TVは 第32回日本分子生物学会年会 2日目に開催されたワークショップ「ウエット研究者が情報技術的に自立するために:統合データベースプロジェクトからの提案」から、ライフサイエンス統合データベースセンター 坊農秀雅 による「統合データベースプロジェクト:オープンで知のめぐりの良い分子生物学を目指して」をお送りします。

ライフサイエンス統合データベースプロジェクトが目指すもの、また現在鋭意開発中の次世代シーケンサーを使った発現情報の統合化システム togoexp について紹介されています。

約26分です。

ニコニコ動画版はこちらです。

YouTube版はこちらです。

発表PDFはこちら

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また、JavaScriptをOnにする必要があります。
Keywords: 次世代シーケンサ、ゲノムマッピング、togoexp、refexp、Buncher
References: 19430453

スライドをクリックすると、その場面から動画をご覧になれます。

タイトル 我が国には長期的な視点に立ったデータベース戦略がない DBCLS誕生 DBCLSとは DBCLS構成員 DBCLSの三本柱 文部科学省統合データベースプロジェクト DB統合化に向けた基本的考え方 4つ 統合DBは完結しないプロセスである 一つの統合DBではなく研究開発の生産性向上を目指す DB化されないものもうまく扱えるように 研究開発は行うがサービス業であることを認識 ライフサイエンスデータの浄水処理場と下水処理場 提供しているサービス 開発中のサービス 発現統合プロジェクトtogoexp 発現統合プロジェクトのとりくみ 統合TV 主成分分析による統合TVの分類 BODYMAP XS togoexp the next generation refexpデータセットの維持に必要なもの tools for TNG sequence data and pipeline for those ゲノムにマッピングするツール トランスクリプトームをゲノムにマッピングする なぜ再解析が必要か? こんなのが欲しい! Buncher pipeline overview Sequence data source for refexp Data for refexp Human data set interface for regexp visualization preliminary version of refexp top page preliminary version of buncher output browser Example Example 拡大図 To visualize Application of body mapping バリアントをどう扱うか? まとめ 募集 Contact


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