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TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2009-09-25

_ [遺伝子][発現情報][可視化] DAVIDを使ってマイクロアレイデータを解析する 2012

DAVIDを使ってマイクロアレイデータを解析する 2012

DAVIDはマイクロアレイ実験から得られたデータを解析するツールです。このツールを使うことで発現変動のあった遺伝子群の特徴を可視化し、直感的に分析することができます。DAVIDという名前はThe Database for Annotation, Visualization and Integrated Discoveryの頭文字に由来しています。

ムービーではサンプルデータとして、NCBI GEOに登録されている公共の遺伝子発現データ(GSE17913:Effects of Cigarette Smoke on the Human Oral Mucosal Transcriptome)からGEO2Rを用いて取得した、喫煙者女性と非喫煙者女性の口腔内で発現に差のある250個の遺伝子群のリストを使って説明しています。GEO2Rを使ったデータの取得についてはこちらをご覧ください。

画像をクリックすると2012年作成の最新版が再生されます。

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※動画にはBGM音声が付与されていますので、閲覧の際にはご注意ください。

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. リストのアップロード(31秒)
  2. 2. Functional Annotation Clustering(2分3秒)
  3. 3. Functional Annotation Chart(4分58秒)
  4. 4. Functional Annotation Table(5分28秒)
  5. 5. Gene Functional Classification(5分53秒)

YouTube版はこちらです。


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