SOSUIとTMHMMは、アミノ酸配列を元に、膜タンパク質であるかどうかの判別や、膜貫通領域を予測するツールです。SOSUIは配列相同性などを参照しない物理化学的な手法により、99%という高精度で膜タンパク質を判別することができます。また、TMHMM (Transmembrane Hidden Markov Model) は、隠れマルコフモデルを使った膜貫通領域予測ツールです。 今回はウシロドプシン(Bovine Rhodopsin)のアミノ酸配列を例として、検索の方法を解説します。