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2009-07-22

_ [macosx][Firefox][遺伝子] Gene Ontologyを使って特定遺伝子の機能情報を検索する

Gene Ontologyを使って特定遺伝子の機能情報を検索する 2011

Gene Ontologyとは、遺伝子の機能の記述に関して、生物学分野における共通語彙の作成を目指した用例辞書の一つです。Gene Ontologyの特徴として、定義された用語は

  • bioogical process(生物学的プロセス)
  • cellular component(細胞の構成要素)
  • molecular function(分子機能)

の3つのカテゴリーに分類されます。そして、個々の用語はDAG(無閉路有向グラフ)という階層構造として意味的な包含関係を表す形で関連づけられています。

ここでは、ヒトのHomeoboxタンパク質であるnanogを例にとって、その機能情報を検索しています。

画像をクリックすると2011年作成の最新版が再生されます。

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1.タンパク質の詳細を調べる (30秒)
  2. 2.GOタームの分類について (1分27秒)
  3. 3.タンパク質の機能情報を調べる(2分49秒)
  4. 4.GOタームの階層構造について (3分58秒)

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また、JavaScriptをOnにする必要があります。
Keywords: 遺伝子,機能情報,ontology,gene,GO,gene ontology

YouTube版はこちらです。


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