InterProScanは、アミノ酸配列の特徴を複数のデータベースを対象にまとめて検索することによって、問い合わせた配列が属するタンパク質ファミリーやドメイン構成およびモチーフなどの特徴を効率的に推測することができるツールです。 興味のあるタンパク質の機能が未知であるとき、配列解析によって機能注釈を行いたいといった場面で、配列相同性検索と同様によく用いられるのがモチーフ・ドメイン検索です。InterProScanはそういった場面で用いられる最も代表的なツールです。ムービーではサンプルデータとして、ES細胞の分化多能性を支えるHomeoboxタンパク質である
Nanogのアミノ酸配列を使って説明しています。