2009-06-04 InterProScanを使ってアミノ酸配列の特徴を検索する

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InterProScanは、アミノ酸配列の特徴を複数のデータベースを対象にまとめて検索することによって、問い合わせた配列が属するタンパク質ファミリーやドメイン構成およびモチーフなどの特徴を効率的に推測することができるツールです。 興味のあるタンパク質の機能が未知であるとき、配列解析によって機能注釈を行いたいといった場面で、配列相同性検索と同様によく用いられるのがモチーフ・ドメイン検索です。InterProScanはそういった場面で用いられる最も代表的なツールです。ムービーではサンプルデータとして、ES細胞の分化多能性を支えるHomeoboxタンパク質であるNanogのアミノ酸配列を使って説明しています。

見どころダイジェスト

この動画を引用する際はDOIをご利用ください。 DOI: 10.7875/togotv.2009.050

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