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TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2009-06-04

_ [macosx][Firefox][配列解析][アミノ酸][タンパク質][遺伝子] InterProScanを使ってアミノ酸配列の特徴を検索する

interproscan

InterProScanは、アミノ酸配列の特徴を複数のデータベースを対象にまとめて検索することによって、問い合わせた配列が属するタンパク質ファミリーやドメイン構成およびモチーフなどの特徴を効率的に推測することができるツールです。

興味のあるタンパク質の機能が未知であるとき、配列解析によって機能注釈を行いたいといった場面で、配列相同性検索と同様によく用いられるのがモチーフ・ドメイン検索です。InterProScanはそういった場面で用いられる最も代表的なツールです。

ムービーではサンプルデータとして、ES細胞の分化多能性を支えるHomeoboxタンパク質であるNanogのアミノ酸配列を使って説明しています。

画像をクリックするとFlash版のムービーが再生されます。

Flashよりも高画質なQuickTimeムービー版はこちらをご覧下さい。

YouTube版はこちらです。


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