attedと検索します。
"ATTED-II:Home"(http://atted.jp/)をクリック
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このデータベースでは、シロイヌナズナの遺伝子発現データを用いて、その機能や共発現遺伝子などを調べることができます。
"Search"をクリック
このページで実際に検索を行います。
まず、＜GeneTable＞を使って興味のある遺伝子の機能や細胞内局在予測部位を調べてみましょう。
調べたい遺伝子のAGIコードを入力します。
入力したら、"submit"をクリック
遺伝子のAGIコード
細胞内局所部位
遺伝子の機能
細胞内局所予測部位については各アルファベットにマウスを乗せると、長い部位名を見ることができます。
左はTAIRのTargetP、右はWoLFPSORTでの結果を表しています。
AGIコードをクリック
この遺伝子の発現に関する詳しい情報を見ることができます。
この遺伝子を含むGeneOntologyのグループ一覧です。
GeneOntologyのうち、根拠のコードが高いもの（IDA、IEP等）はPubMedにリンクを貼ってあります。
networkへのリンクをクリックすると。。。
GeneOntologyのネットワークを見ることができます。
この遺伝子を中心として共発現している遺伝子のネットワークです。
各色の丸のついた遺伝子のKEGG ID、機能、個数の表です。
遺伝子をクリックすると、その遺伝子を中心としたより詳しいネットワークを見ることができます。
この遺伝子とネットワーク上で直接関連のある遺伝子の情報です。
クリック
遺伝子At2g39730と共発現している遺伝子の上位３００個を見ることができます。
この遺伝子の各組織や様々な実験条件下における発現状況を示したグラフです。
発現データからATTEDで予測されたこの遺伝子の転写開始点近傍のシス配列が表示されます。
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とても分かりやすくご紹介頂き、ありがとうございます。