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2009-03-28

_ [winxp][IE7][遺伝子][発現情報][配列解析] 植物ESTボディーマップを使い倒す

geo

植物ESTボディーマップは植物の各臓器、組織における遺伝子の発現量をESTを使って推定したデータベースであり、動物のボディーマップBodyMap-Xs を補間するデータを提供しています。植物解剖用語の自動分類プログラムを用いて2772の植物ライブラリをカテゴリー分類し、カテゴリー別遺伝子別にINSDCに登録されているESTの数を数えた結果です。

今回の統合TVでは、植物に対する相同性検索について紹介しています。例として、ヒトの遺伝性乳がんに関与しているといわれている遺伝子"BRCA2"のアミノ酸配列をクエリとして相同な遺伝子を持つ植物を検索し、さらにその詳細を見ています。

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