2009-02-28 PDBjを使ってタンパク質の立体構造を調べる

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PDBj(Protein Data Bank Japan:日本蛋白質構造データバンク)は、 大阪大学蛋白質研究所が運営する蛋白質・核酸・糖などの生体高分子の立体構造およびそれに関連する二次データのデータベースです。 PDBjは、JST-BIRDの支援を受け、米国RCSBおよび欧州EBIと協力して、国際的に統一化されたアーカイブとして運営されており、また様々な解析ツールを提供しているのが特徴です。 今回紹介するxPSSS(XML-based Protein Structure Search Service)はXMLに基づいたタンパク質構造検索サービスです。xPSSSでは様々な条件で検索することができますが、最も単純な検索はPDB IDまたはキーワードによる検索で、PDBjのトップページから直接検索することができます。

見どころダイジェスト

この動画を引用する際はDOIをご利用ください。 DOI: 10.7875/togotv.2009.019

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