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TogoTV international

TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2009-02-28

_ [winxp][IE7][タンパク質] PDBjを使ってタンパク質の立体構造を調べる

PDBj Mineを使ってタンパク質を検索する

PDBj(Protein Data Bank Japan:日本蛋白質構造データバンク)は、 大阪大学蛋白質研究所が運営する蛋白質・核酸・糖などの生体高分子の立体構造およびそれに関連する二次データのデータベースです。

PDBjは、JST-BIRDの支援を受け、米国RCSBおよび欧州EBIと協力して、国際的に統一化されたアーカイブとして運営されており、また様々な解析ツールを提供しているのが特徴です。

今回紹介するxPSSS(XML-based Protein Structure Search Service)はXMLに基づいたタンパク質構造検索サービスです。xPSSSでは様々な条件で検索することができますが、最も単純な検索はPDB IDまたはキーワードによる検索で、PDBjのトップページから直接検索することができます。

画像をクリックすると2011年作成の最新版が再生されます。

Get the Flash Player to see this movie.この動画を再生するにはAdobe Flash Player (無料)が必要です

また、JavaScriptをOnにする必要があります。
Keywords: タンパク質,立体構造,PDBj,Mine,データベース

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. PDBj Mineでタンパク質を検索する。(20秒)
  2. 2. 対話的操作ができるタンパク質の画像を見る。(1分20秒)
  3. 3. 構造、実験条件、機能、その他に関する情報を調べる。(2分06秒)

YouTube版はこちらです。


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