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TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2008-11-07

_ [IE7][winxp][配列解析][遺伝子] ESTデータベース Entrez Unigeneを使い倒す

ESTデータベース Entrez Unigeneを使い倒す 2011

NCBIが提供するデータベースの1つにUnigeneがあります。Unigeneは遺伝子のESTデータベースであり、様々な遺伝子のEST配列を取得することが出来ます。ESTとは"expressed sequence tag"の略でRNAの一部に当たる短い配列であり、転写産物の“目印”として使われています。

また、検索した生物と他の生物種のタンパク質配列を比較することで機能を類推したり、ESTが生物の体のどの部位で得られているかなども知ることが出来ます。

今回は、マウスのsox2遺伝子に関して調べた場合のUnigeneの使い方を紹介しています。

画像をクリックすると2011年作成の最新版が再生されます。

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また、JavaScriptをOnにする必要があります。
Keywords: 遺伝子,塩基配列,タンパク質,EST,発現

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. 遺伝子のmRNAとESTを調べる。(0分38秒)
  2. 2. 体の部位によるEST発現状況を調べる。(1分51秒)
  3. 3. 配列を調べる。(3分08秒)
  4. 4. 配列情報をファイルに保存する。(4分05秒)

YouTube版はこちらです。


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