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TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2008-10-10

_ [winxp][IE7][タンパク質][可視化] 分子可視化ソフト『Chimera』の使い方 応用編

分子可視化ソフト『Chimera』の使い方 2010 応用編

chimera』はPDBファイルなどのデータを元に生体高分子(主にタンパク質)の立体構造を3D画像で表示する分子可視化ソフトです。前回の番組では、このソフトの使い方を、様々な用途別に細かく解説しましたが、今回の番組ではChimeraを使った応用編として、アミノ酸残基の性質別の色分けの方法や原子間距離に応じた範囲選択とそれに伴う原子同士の接触判定の方法についてその使い方を解説しています。

画像をクリックすると2010年作成の最新版が再生されます。

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Keywords: protein,タンパク質,立体構造,chimera,viewer,

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. 残基を性質で色分けし、断面図を見る。(1分12秒)
  2. 2. 選択した原子の周りの原子をリストアップする。(3分31秒)
  3. 3. コマンドラインを使う。(6分22秒)

YouTube版はこちらです。

(統合草子より)本番組は、長浜バイオ大学の竹若浩一さん(学部4年生)による「投稿TV」です。竹若さん、ありがとうございました。


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