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TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2008-04-18

_ [winxp][IE7][ゲノム][可視化][発現情報] Ensembl tips 〜DBCLSで提供しているゲノムアノテーションを表示する〜

Ensembl tips 〜DBCLSで提供しているゲノムアノテーションを表示する〜 2010

Ensemblは、 The Wellcome Trust Sanger InstituteEBI(European Bioinformatics Institute) の共同で開発、維持されているゲノムブラウザ、ゲノムアノテーション閲覧システムのことです。

第四弾の今回は、DBCLSで提供しているゲノムアノテーションをDAS(Distributed Annotation System)を用いてEnsemblに追加して表示する方法について紹介しています。今回は、ヒト、マウスの遺伝子発現を組織細胞の種類ごとに解析したデータベースであるBodyMapのESTデータをEnsembl上で表示させています。

画像をクリックすると2010年作成の最新版が再生されます。

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また、JavaScriptをOnにする必要があります。
Keywords: ゲノム,ブラウザ,Ensembl,DAS,EST,HInv,アノテーション

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. DASの設定(0分40秒)
  2. 2. H-Invのアノテーションを閲覧する(2分18秒)
  3. 3. FANTOM3のアノテーションを閲覧する(4分18秒)

YouTube版はこちらです。


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