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2007-11-08

_ [winxp][Firefox][遺伝子][発現情報][可視化] GO Terms Classifications Counterを使ってマイクロアレイデータを可視化する

gotcc

GO Terms Classifications Counterは、マイクロアレイ実験などで得られた発現変動のあった遺伝子群に付けられたGO termのフラットファイルをuploadすると分類して可視化(集計表とパイチャート)してくれるツールです。このツールを使うことで、発現変動のあった遺伝子群の特徴を概観することができます。

ムービーではサンプルデータとして、NCBI GEOより取得した公共の遺伝子発現データ(GSE1657:Adipocyte Differentiation[Homo sapiens])を用いて、脂肪細胞の分化過程で発現増加した上位100個の遺伝子群のGO IDのリストを使って説明しています。

また、このツールはIE7だと結果の出力がうまくいかないためFirefoxを使っています。

画像をクリックすると2009年作成のムービーが再生されます。YouTube版はこちらです。


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