2018-07-10 UCSC Genome Browserで表示できるアノテーションを調べる 2018

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UCSC Genome Browserは、 米国カリフォルニア大学サンタクルーズ校(UCSC)が開発、維持しているゲノムブラウザ、ゲノムアノテーション閲覧システムです。ゲノムブラウザとはアノテーション(注釈)が付加された遺伝子のゲノム上の位置やその周辺を表示するツールのことです。今回は、UCSC Genome Browserで閲覧できる多種多様なアノテーション情報について、ゲノムアセンブリによる違いやアノテーションの一覧から検索し表示させる方法などを紹介します。
ちなみに、UCSC Genome Browser のウェブサイトはヨーロッパとアジアにミラーサイトがあり(UCSC Genome Browser Mirror Sites)、日本からアクセスする場合には、アジアのミラーサイト(RIKEN横浜キャンパス)を使うとさらに高速です。

この動画を引用する際はDOIをご利用ください。 DOI: 10.7875/togotv.2018.124

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