2015-07-21 GGGenome 《ゲゲゲノム》 で転写因子結合サイトを検索してゲノムブラウザに表示する

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GGGenomeは塩基配列を高速に検索することができるツールです。代表的なモデル生物のゲノムまたは転写産物のデータベースを対象に検索できます。 今回は、応用編として、N (any), R (A or G), Y (C or T) 等のあいまいな塩基を含む配列の検索方法と、その検索結果をUCSCゲノムブラウザ上で可視化する方法について紹介します。

この動画を引用する際はDOIをご利用ください。 DOI: 10.7875/togotv.2015.067

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