2011-12-17 BioPortalとProtegeを利用した生命科学オントロジーの作成

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本日の統合TVは2011年12月6日にライフサイエンス統合データベースセンターにて行われたオントロジー作成の講習会をお送りします。 RDFとオントロジーについての説明の後、NBDC生命科学系データベースアーカイブに収録されている酵母タンパク質の相互作用データベース(Yeast Interacting Proteins Database)を使って簡単なオントロジーを作成する実演が行われています。今回の講習では、生命科学オントロジーのレポジトリであるNCBOBioPortalDBCLSで開発しているオントロジー検索ツールOntoFinder、オントロジー編集ツールのProtégé 3.4.7 (最新版はBioPortalに対応していないそうです。(2011年12月7日現在))などが使われています。講師はライフサイエンス統合データベースセンター・特任准教授 金進東です。

この動画を引用する際はDOIをご利用ください。 DOI: 10.7875/togotv.2011.151

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