2009-02-20 Ensembl tips 〜塩基配列のアラインメントを作成する〜2009

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Ensemblは、 The Wellcome Trust Sanger InstituteEBI(European Bioinformatics Institute) の共同で開発、維持されているゲノムブラウザ、ゲノムアノテーション閲覧システムのことです。第三弾の今回は、Ensemblを使って遺伝子の塩基配列を生物種間で比較し、そのアラインメントを作成・閲覧する方法について紹介しています。以前の番組で紹介した CLUSTALWで配列のアラインメントを作成すると内容的には同じですが、CLUSTALWを用いる場合は比較する塩基配列を自分で用意しなければいけません。Ensemblではその手間が省けるほか、遺伝子のプロモーター配列が存在する上流配列などを付加した上で簡単にアラインメントを作成することができます。

見どころダイジェスト

この動画を引用する際はDOIをご利用ください。 DOI: 10.7875/togotv.2009.013

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