2008-05-23 Biomartを使い倒すIDの対応表を作成する

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Biomartは、the Ontario Institute for Cancer Research (OiCR)the European Bioinformatics Institute (EBI) が共同で開発している(になりました)クエリ指向型データ管理システムです。これを使うといろいろなことができますが、今回は以前にも紹介しましたIDの対応表を作成するやり方を最新のBiomartのウェブインターフェースで再度紹介しています。具体的には、BioMart Central Portalを使って、Affymetrix mouse430 2のマイクロアレイにある遺伝子セットに絞り込んでからEnsembl Gene IDを介してRefSeq IDとEntrezGene IDを対応づけた表を作成しタブ区切りテキストにしてダウンロードする手順を紹介しています。

見どころダイジェスト

この動画を引用する際はDOIをご利用ください。 DOI: 10.7875/togotv.2008.029

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