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バイオの買物.comは、ライフサイエンス分野でよく使われる試薬などの製品情報を各メーカーから収集し、研究者が、最も適した製品を簡単に確実に発見できることを目的としたサイトです。「製品を検索する」だけではなく「新しい製品を発見できる」カタログを目指して作られています。
検索機能が充実しており、各製品が細かくカテゴリー分けされているのが大きな特徴で、より多くの情報を網羅するために、スポンサー以外のメーカーの製品情報も掲載されています。
※動画にはBGM音声が付与されていますので、閲覧の際にはご注意ください。
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本日の統合TVは、2013年4月26日に放送された、第壱回 不寝ラジオから、坊農 秀雅 による「統合TV、誕生」をお送りします。約53分です。
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PANTHERはマイクロアレイ実験から得られたデータを解析するツールです。このツールを使うことで発現変動のあった遺伝子群の特徴を可視化し、直感的に分析することができます。PANTHERという名前はProtein ANalysis THrough Evolutionary Relationshipsの頭文字に由来しています。
ムービーではサンプルデータとして、NCBI GEOに登録されている公共の遺伝子発現データ（GSE1657:Adipocyte Differentiation）を用いて、ヒトの脂肪細胞の分化過程で発現増加した上位500個の遺伝子群のリストを使って説明しています。
Biomartを使ったマイクロアレイ IDからEnsembl IDへの変換についてはこちらをご覧ください。
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Strapは、複数のタンパク質を立体構造や配列を比較しながら整理できる、フリーのJavaアプリケーションです。タンパク質の系統樹の作成や二次構造の予測、また整理した配列を図に変換することもできます。OSはWindows, Macintosh, Linux, Unixに対応しています。
基本編はこちらです。
今回はStrapの発展的な使い方として、キャッシュを用いない検索、3D画像の重ねあわせ、相同性の可視化、系統樹の作成、ドットプロット、二次構造の予測の方法などを紹介しています。
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ImageJは、NIH(National Institutes of Health)が開発した画像解析フリーウェアです。
これまでにImageJの使いかたを2つ紹介して来ました。「ImageJを利用して画像を処理・解析する」、「ImageJを利用して画像を処理・解析する-2」
ところで、ImageJには、特殊化された用途に合わせて開発されたパッケージが多数存在します。
今回は、その中から生命科学系の画像処理に適したパッケージFijiの使い方を紹介します。
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本日の統合TVは、2013年3月22日に開催された、統合データベース講演会: AJACS本郷13（第4回統合牧場収穫祭）から、@iNut改め 統合亭犬太郎 による「次世代おもろい話」をお送りします。約12分です。
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本日の統合TVは、2013年3月22日に開催された、統合データベース講演会: AJACS本郷13（第4回統合牧場収穫祭）から、@wakuteka による「第4回統合牧場収穫祭 飛び入りゲストトーク」をお送りします。約5分です。
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本日の統合TVは、2013年3月22日に開催された、統合データベース講演会: AJACS本郷13（第4回統合牧場収穫祭）から、@ahneahneahne による「Ahne! 研究者を繋げる」をお送りします。約13分です。
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本日の統合TVは、2013年3月22日に開催された、統合データベース講演会: AJACS本郷13（第4回統合牧場収穫祭）から、@dritoshi による「The Origin of Farm」をお送りします。約19分です。
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本日の統合TVは、2013年3月22日に開催された、統合データベース講演会: AJACS本郷13（第4回統合牧場収穫祭）から、@bonohu による「知のめぐりの良い統合牧場RAのたった一つの心得」をお送りします。約10分です。
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本日の統合TVは、2013年3月22日に開催された、統合データベース講演会: AJACS本郷13（第4回統合牧場収穫祭）から、@Pankakoski による「Perlと私と牧場と」をお送りします。約6分です。
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本日の統合TVは、2013年3月22日に開催された、統合データベース講演会: AJACS本郷13（第4回統合牧場収穫祭）から、@tabris2012 および@gackelNLによる「新着論文レビューをテキストマイニング3.0: Q」をお送りします。約50分です。
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