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統合TV (togotv) [塩基配列]

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塩基配列

  • 2007-08-01#p01 EnsemblでSayaMatcherDAS
  • 2007-08-03#p01 EnsemblでSayaMatcherDAS
  • 2007-08-06#p01 BiomartでIDの対応表を作成する
  • 2007-08-08#p01 NCBI BLASTを使って機能未知塩基配列の機能を推定する
  • 2007-08-09#p01 CLUSTALWで配列のアラインメントを作成する
  • 2007-08-24#p01 Primer3でPCR用のプライマーを設計する。
  • 2007-08-29#p01 高速アラインメントツールBLATをプライマー設計支援ツールとして使い倒す
  • 2007-09-06#p01 siDirectでsiRNAを設計する
  • 2007-09-14#p01 ウイルスの持ち出した宿主の遺伝子配列がコードされている領域をアミノ酸配列レベルでゲノム中から探し当てる
  • 2007-09-27#p01 遺伝子発現パターンが似ている遺伝子群のゲノム上流配列を一気に取得する
  • 2007-11-07#p01 NEBcutterでDNA配列を切り倒す!
  • 2007-11-20#p01 EMBOSS transeqで塩基配列をアミノ酸配列に変換する
  • 2008-02-14#p01 Ensembl tips 配列の比較をする
  • 2008-02-21#p01 Ensembl tips 〜配列を取得する〜
  • 2008-03-06#p01 Ensembl tips 〜塩基配列のアラインメントを作成する〜
  • 2008-03-17#p01 UCSC Gene Sorterを使って遺伝子間の関連性を探索する
  • 2008-05-14#p01 DNAデータベース総覧と検索を使い倒す
  • 2008-05-23#p01 Biomartを使い倒す-IDの対応表を作成する
  • 2008-08-06#p01 統合データベース講習会:AJACS本郷1 DBCLS独自サービス「目次」、「カタログ」系の使いこなし術/教育・人材育成のリソース紹介他
  • 2008-08-08#p01 PCRプライマー設計ツール Primer3の使い方
  • 2008-09-26#p01 遺伝子のRefSeq IDを調べる
  • 2008-10-11#p01 配列のアラインメント作成ツールClustalWを使い倒す
  • 2008-11-29#p01 EMBOSS revseqを使い倒す
  • 2008-11-30#p01 EMBOSS backtranseqを使い倒す
  • 2008-12-06#p01 EMBOSS fuzznucを使い倒す
  • 2008-12-11#p01 tRNAデータベース『tRNADB-CE』の使い方
  • 2008-12-24#p01 Local blast の使い方〜ダウンロード編〜
  • 2008-12-25#p01 Local blast の使い方〜設定編〜
  • 2008-12-26#p01 Local blast の使い方〜データベース準備編〜
  • 2008-12-27#p01 Local blast の使い方〜検索実行編〜
  • 2008-12-28#p01 Local blast の使い方〜オプションを使った検索編〜
  • 2009-02-06#p01 Ensembl tips 〜配列を取得する〜 2009
  • 2009-02-20#p01 Ensembl tips 〜塩基配列のアラインメントを作成する〜2009
  • 2009-02-25#p01 Biomartを使い倒す-マイクロアレイprobeIDの対応表を作る
  • 2009-03-04#p01 How to make probeID list for microarray using Biomart
  • 2009-03-10#p01 Galaxyを使い倒す-特定の転写因子予測結合領域と遺伝子上流領域の「交差点」をリストアップする
  • 2009-03-12#p01 How to list the intersection of specific TFBS and upstream region of genes using Galaxy
  • 2009-03-27#p01 Biomartを使い倒す〜遺伝子の上流配列を取得する〜2009
  • 2009-04-03#p01 GOLD -Genomes Online Databaseを使い倒す 2009
  • 2009-05-22#p01 ATTED-IIを使い倒す
  • 2009-06-19#p01 高速アラインメントツールBLATをプライマー設計支援ツールとして使い倒す2009
  • 2009-06-26#p01 WolframAlphaを使い倒す
  • 2009-07-08#p01 NCBI BLASTを使って類似配列を検索する
  • 2009-07-17#p01 Trace Archiveを使い倒す
  • 2009-07-24#p01 EMBOSS prettyseqを使い倒す
  • 2009-07-25#p01 EMBOSS geeceeを使い倒す
  • 2009-08-07#p01 The Arabidopsis Information Resource (TAIR)を使い倒す
  • 2009-08-21#p01 EMBOSS sixpackを使い倒す
  • 2009-09-04#p01 EMBOSS mergerを使い倒す
  • 2009-09-18#p01 EMBOSS dottupを使い倒す
  • 2009-09-24#p01 EMBOSS needleを使い倒す
  • 2009-10-22#p01 DNAデータベース総覧と検索を使い倒す〜基本編
  • 2009-10-30#p01 EMBOSS emmaを使い倒す
  • 2009-10-31#p01 DNAデータベース総覧と検索を使い倒す〜配列検索編
  • 2009-11-05#p01 UCSC Gene Sorterを使って遺伝子間の関連性を探索する
  • 2009-11-06#p01 EMBOSS waterを使い倒す
  • 2009-11-12#p01 EMBOSS wordmatcherを使い倒す
  • 2009-11-13#p01 UCSC Genome Browserの使い方 〜基本編
  • 2009-11-19#p01 統合データベース講習会:AJACSりんくう〜FANTOM4プロジェクトに見る次世代シーケンサの可能性とデータベース〜
  • 2009-11-20#p01 統合データベース講習会:AJACSりんくう〜DNAデータベースの使い方〜
  • 2009-11-26#p01 UCSC Genome Browserの使い方 〜表示編
  • 2009-12-17#p01 UCSC Genome Browserの使い方〜配列取得編〜 2013
  • 2009-12-18#p01 EMBOSS showalignを使い倒す
  • 2010-02-04#p01 KazusaMartを使い倒す〜塩基配列を入手する〜
  • 2010-02-16#p01 KazusaMartを使い倒す〜オーソログ一覧を作成する〜
  • 2010-02-26#p01 EMBOSS restrict,remapを使い倒す
  • 2010-03-02#p01 CLC Sequence Viewerを使い倒す〜導入から基本操作まで〜
  • 2010-03-15#p01 Ensembl tips 配列の比較をする 2010
  • 2010-03-29#p01 BioMartを使い倒す 比較ゲノミクス編
  • 2010-04-15#p01 NCBI BLASTの使い方 〜基本編〜 2010
  • 2010-05-10#p01 CLC Sequence Viewerを使い倒す〜外部データの取り込みから制限酵素切断地図の作成まで〜
  • 2010-05-11#p01 Primer BLASTの使い方
  • 2010-05-19#p01 Website for Alternative Splicing Predictionの使い方
  • 2010-06-17#p01 今日からはじめるDDBJ Read Annotation Pipeline
  • 2010-06-24#p01 MiGAPの使い方〜導入と基本操作〜
  • 2010-07-04#p01 SAKURAを用いた塩基配列登録の方法
  • 2010-07-20#p01 生体分子の熱力学・構造データベースProTherm&ProNITの使い方
  • 2010-08-21#p01 DDBJ の紹介
  • 2010-08-22#p01 配列データの検索
  • 2010-09-02#p01 SAKURAを用いた塩基配列登録の方法(基本編)
  • 2010-09-28#p01 Case Control GWAS Databaseの使い方
  • 2010-10-07#p01 CNV Control Databaseの使い方
  • 2010-10-15#p01 ウイルスの持ち出した宿主の遺伝子配列がコードされている領域をアミノ酸配列レベルでゲノム中から探し当てる 2010
  • 2010-10-22#p01 NCBI Genome Workbenchを使い倒す〜導入・概要編〜
  • 2010-12-16#p01 miRBaseの使い方
  • 2011-01-11#p01 PCRプライマー設計ツール Primer3の使い方 2011
  • 2011-01-19#p01 Local BLAST の使い方〜導入・準備編〜 2011
  • 2011-02-16#p01 ClustalWを使い倒す 2011
  • 2011-02-17#p01 microRNA.orgの使い方
  • 2011-02-18#p01 遺伝子のRefSeq IDを調べる 2011
  • 2011-02-25#p01 Local BLAST の使い方〜検索実行・オプション編〜 2011
  • 2011-02-26#p01 DDBJ Read Annotation Pipelineによるde novo Assembly解析
  • 2011-04-13#p01 Ensemblの使い方 〜配列を取得する〜 2011
  • 2011-04-20#p01 Local BLAST の使い方〜導入・準備編(MacOSX版)〜 2011
  • 2011-05-27#p01 Biomartを使い倒す〜遺伝子の上流配列を取得する〜 2011
  • 2011-06-06#p01 siDirectでsiRNAを設計する 2011
  • 2011-06-08#p01 Local BLAST の使い方〜検索実行・オプション編(MacOSX版)〜 2011
  • 2011-06-28#p01 CLC Genomics Workbench でショートリードのマッピングを行う
  • 2011-07-05#p01 MEGAを使って配列アラインメントおよび系統解析をする
  • 2011-07-12#p01 siDirectのオプションを使いこなす&shRNAを設計する
  • 2011-07-25#p01 GOLD -Genomes Online Databaseを使い倒す 2011
  • 2011-08-05#p01 NCBI BioProjectの使い方
  • 2011-09-14#p01 CentroidFoldを使ってRNAの2次構造を予測する
  • 2011-09-16#p01 Ensembl tips 配列を比較する 2011
  • 2011-10-24#p01 mfoldを使って核酸の二次構造を予測する〜基本操作編〜
  • 2011-10-25#p01 mfoldを使って核酸の二次構造を予測する〜応用編〜
  • 2011-12-16#p01 NetStartを使って開始コドンを予測する
  • 2012-01-24#p01 GGRNAで遺伝子をGoogleのように検索する
  • 2012-05-25#p01 DBCLS Galaxy EMBOSSの使い方〜配列変換編〜
  • 2012-06-15#p01 DBCLS Galaxy EMBOSSの使い方〜アラインメント編〜
  • 2012-06-28#p01 BioMartを使って二つの生物種の対応するデータを取得する 2012
  • 2012-07-20#p01 BioMartを使い倒す〜遺伝子の上流配列を取得する〜2012
  • 2012-08-21#p01 DBCLS Galaxy EMBOSSの使い方〜配列検索編〜
  • 2012-08-27#p01 DBCLS Galaxy EMBOSSの使い方〜ドットプロット編〜
  • 2012-10-30#p01 ウイルスの持ち出した宿主の遺伝子配列がコードされている領域をアミノ酸配列レベルでゲノム中から探し当てる 2012
  • 2013-05-27#p01 ApE(A plasmid Editor)を利用してプラスミドを設計する
  • 2013-10-25#p01 高速配列検索 GGGenome《ゲゲゲノム》の使い方
  • 2013-10-29#p01 GOLD -Genomes Online Databaseを使い倒す 2013
  • 2013-11-13#p01 UCSC Genome Browserの使い方〜配列取得編〜 2013
  • 2013-12-18#p01 GeneStudioを使って塩基配列をアセンブルする
  • 2014-08-30#p01 BioMart v0.9を使い倒す 〜遺伝子情報や配列を取得する〜
  • 2014-12-10#p01 DBCLS SRAを使ってNGSデータを検索する
  • 2015-03-16#p01 Clustal Omega を使ってマルチプルアラインメントを行う
  • 2015-04-13#p01 MAFFT を使ってマルチプルアラインメントを行う
  • 2015-07-14#p01 HomoloGeneを用いた相同的な遺伝子の検索
  • 2015-07-21#p01 GGGenome《ゲゲゲノム》で転写因子結合サイトを検索してゲノムブラウザに表示する
  • 2015-10-30#p01 Blast2GOを使ってシーケンス配列の機能アノテーションを行う
  • 2016-02-04#p01 Functional Annotation of Sequences using Blast2GO
  • 2016-04-04#p01 SequenceServerを使って自分のPCで簡単BLAST検索
  • 2016-04-18#p01 DOGAN - Genome Database of Microorganisms Sequenced at NITE - の使い方
  • 2016-06-16#p01 GeneTrail2を使って、エンリッチメント解析を行う