塩基配列の検索、取得、比較を行う

NCBI BLASTの使い方 〜基本編〜 2017

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NCBI BLASTの使い方 〜基本編〜 2017

NCBI BLAST(えぬしーびーあいブラストと発音します)は、問い合わせ配列に類似した配列をデータベース中から検索するツールです。BLASTの名称はBasic Local Alignment Search Toolの頭文字に由来しており、配列解析には欠かせない、基本的なツールです。塩基配列を問い合わせ配列として、nr/ntデータベース(冗長性を排した塩基配列データベース)に対して検索を行い、機能を推定する使い方を説明します。もちろん、塩基配列だけではなく、アミノ酸配列に対しても使えます。

見どころダイジェスト

  • 01:28 1. Nucleotide BLAST を実行する
  • 02:50 2. BLAST検索の結果
  • 03:41 3. スコアの見方

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170321_NCBI_BLAST.mov

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