Open Refine(旧Google Refine)の使い方 応用編・TogoWS RESTを活用する

Open Refineは、さまざまなデータをきれいに整形したり、欲しい形のものに変換したり、簡単な解析を行ったりすることができるソフトで、表計算ソフトExcelにはないさまざまな機能を持っています。前回「Open Refine(旧Google Refine)の使い方 〜導入・基本編〜」の動画では、Open Refineのダウンロード、およびCSVファイルを用いた文字データと数字データの整形について紹介しました。今回は、Open Refineと、TogoWS RESTというDBCLSの提供するサービスを用いて、大量の遺伝子やタンパク質のIDのリストから、それぞれのIDに関連するアノテーションを一括取得する方法を紹介します。

見どころダイジェスト

  • 1. TogoWS RESTの紹介(18秒)
  • 2. GenBank nucleotide IDのリストから各遺伝子のアノテーションを一括取得する (59秒)
  • 03:09 3. 同じIDのリストから各遺伝子の個々のアノテーションを取得する

動画ファイルのダウンロード

130530openrefine2.mov

再利用時のライセンス

クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0

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