MMDBを使ってタンパク質の構造を知る

MMDBNCBIが提供するデータベースの一つです。MMDBではタンパク質やRNAの立体構造を知ることができます。また、それが複合体を形成していればそれぞれの物質の位置関係などを知ることもできます。MMDBはNCBIの他のデータベースであるPubChem,PubMed, CDDなどと相互連携しています。 今回は、MMDBの使い方として、構造が知りたいタンパク質に関連するページの探し方と、その見方を紹介しています。

見どころダイジェスト

  • 00:37 1.NCBI、またはMMDBのページの"Structure"から構造を直接検索
  • 01:19 2.MMDBのページの見方
  • 04:27 3.アラインメントを利用した類似構造の検索
  • 08:32 4.GI numberから直接検索

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121105MMDB.mov

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