RCSB PDBを使ってタンパク質の立体構造を調べる 2011

RCSB PDB (Protein Data Bank)は、タンパク質の立体構造データベースです。立体構造のデータは、タンパク質を構成する原子の座標データとして保存されています。今回は、オプシンを例として「タンパク質の立体構造を調べる」という基本的な利用方法を解説するほか、PDBファイルをダウンロードせずに内容を参照したり、ブラウザ上で構造を確認する方法を解説します。PDB IDやキーワード以外にもAuthor・タンパク質の分類・分子機能など様々な条件から構造を検索することが可能です。

見どころダイジェスト

  • 01:56 1. キーワードによる検索
  • 03:00 2. 構造ページのアイコン内容説明
  • 04:18 3. Jmolによる立体構造の表示
  • 05:07 4. 詳細ページの内容説明

動画ファイルのダウンロード

110830RCSBPDB.mov

再利用時のライセンス

クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0

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