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TogoTV international

TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2009-08-22

_ [winxp][可視化][発現情報][遺伝子][ゲノム] Spotfireを用いた比較トランスクリプトミクス

spotfiretranscriptomics

今回の統合TVでは、データ可視化ツールであるSpotfire DecisionSiteを用いたマイクロアレイ解析の一事例を紹介します。

マイクロアレイ上に載っている遺伝子群(プローブセット)を異なる生物種間(今回はヒトとマウス)で対応付けを行い、同じ臓器での発現パターンを比較解析する例を紹介します。マイクロアレイIDの対応付けはEnsemblのBioMartで容易に取得することができます。今回例として用いたデータは、BioGPSで閲覧できるヒト・マウスの各組織・細胞株のマイクロアレイデータです。

画像をクリックするとFlash版のムービーが再生されます。

Flashよりも高画質なQuickTimeムービー版はこちらをご覧下さい。

YouTube版はこちらです。

2006年当時に作成した解説PDF(クリックするとPDFが開きます)はこちらです。


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